Liko, gadis dari wilayah Pardea, mendaftar di Sekiei Gakuen, sebuah sekolah asrama di wilayah Kanto. Liko senang menerima Pokémon Sprigatito pertamanya, tetapi Sprigatito sama sekali tidak mendengarkannya… Liko berjuang untuk memperdalam ikatannya dengan Sprigatito. Sementara itu, untuk mencari “liontin misterius” Liko, karakter-karakter mencurigakan muncul untuk mencarinya!
