Natsume menemukan bahwa pusaka “Buku Teman” yang diberikan oleh neneknya, Reiko, memiliki nama-nama roh yang dia kalahkan dan terikat pada keinginannya. Dibantu oleh seekor kucing yang disebut Natsume sebagai Nyanko-Sensei (lit. Master Little Meow), Natsume bertujuan untuk mengembalikan semua nama itu kepada pemiliknya yang sah.
