Athrun ikut campur dalam pertarungan antara Kira, Shinn, dan Rey, yang mengejutkan Shinn yang percaya bahwa dia telah membunuh Athrun sebelumnya. Yuna dihancurkan oleh GOUF Ignited ketika dia mencoba melarikan diri sementara Djibril berhasil melarikan diri ke Bulan dengan menggunakan pesawat ulang-alik yang mengorbit. Dengan hancurnya kapal utama ZAFT, Kapten Gladys mengambil alih komando dan memerintahkan mundur sementara. Setelah pertempuran, Cagalli menyiarkan pengumuman global tentang perang dengan Logos tapi dia diinterupsi oleh Meer, yang pada gilirannya diinterupsi oleh Lacus yang asli.
