Aliansi Tiga Kapal yang baru dibentuk berlindung di koloni Mendel yang ditinggalkan. Sayangnya, mereka dilacak oleh pasukan ZAFT dan Earth Alliance. Rau Le Creuset memimpin armada ZAFT dan Kapten Natarle Badgiruel, memimpin kapal serbu Aliansi Bumi Dominion. Dominion mengambil inisiatif dan menyerang dengan misi merebut Kebebasan atau Keadilan.
