Athrun kembali ke TANAMAN dengan pesawat ulang-alik untuk berbicara dengan ayahnya, tapi dia ditangkap. Lacus dan (yang diduga tewas dalam aksi) Andrew Waltfeld bergabung, mencuri kapal pendukung ZAFT, Eternal dan menyelamatkan Athrun. Mereka bergabung dengan Malaikat Agung dan Kusanagi sehingga membentuk Aliansi Tiga Kapal.
