Setelah Mitsuki mengungkapkan lebih banyak informasi tentang insiden Hantu, Boruto bertekad untuk menemukan dan menghentikan pelakunya! Sementara itu, Hokage Ketujuh Naruto dan penasihat utamanya terkejut mengetahui siapa pelakunya dari hasil penyelidikan Sai. Saat itu, Nue—binatang dunia lain yang sangat besar—muncul! Bahaya yang mengancam desa memaksa Hokage Keenam, Kakashi, keluar dari pensiun!
