Era Meiji adalah salah satu pembaruan besar bagi Jepang, di mana pedang dan pembunuhan dilarang. Namun, banyak orang yang selamat dari masa Revolusi masih hidup, bersembunyi di balik bayang-bayang dan menunggu kesempatan untuk menggunakan pedang pembunuh mereka lagi. Hanya Kenshin Himura, mantan salah satu pembunuh paling brutal, yang berharap dapat menjaga kehormatan pendekar pedangnya dan tetap hidup di era baru.
