Ketika virus yang menginfeksi hantu yang dikenal sebagai Fire-Starter mulai menyebar melalui sistem yang mengakibatkan pembunuhan Perdana Menteri Jepang, Mayor Motoko Kusanagi dan tim elitnya dari operasi khusus dipanggil untuk melacak sumbernya.


Ketika virus yang menginfeksi hantu yang dikenal sebagai Fire-Starter mulai menyebar melalui sistem yang mengakibatkan pembunuhan Perdana Menteri Jepang, Mayor Motoko Kusanagi dan tim elitnya dari operasi khusus dipanggil untuk melacak sumbernya.